Nuevo Cohorte De Biólogo a Operador de Supercomputadores

De leer papers con supercomputadores a correr tus propias simulaciones en un fin de semana.

Curso intensivo y en vivo para biólogos, químicos, biomédicos y científicos que quieren usar clusters HPC reales sin volverse programadores.

“No necesitas ser programador. Necesitas ser el científico que sabe exprimir cada núcleo de CPU de un supercomputador mientras los demás siguen esperando que alguien más lo haga por ellos.”
📅 Inicia: Sábado 06 de junio 2026 ⏱ 14 horas · 2 fines de semana 🧑‍🏫 100% en vivo por Zoom 🌎 Idioma: Español

Grupo reducido para poder ayudarte en tiempo real cuando algo no compila o la simulación no corre.

Si te reconoces en esto, este curso es para ti

  • 😩
    Intentaste instalar GROMACS en tu laptop y después de tres horas de errores en la terminal, lo dejaste “para después”. Ese “después” sigue en tu lista desde hace meses.
  • Corriste una simulación pequeña en tu computadora personal y tardó cuatro días en terminar lo que un clúster HPC haría en 45 minutos.
  • 🏛️
    Tu universidad tiene acceso a un clúster nacional (FENIX, NLHPC, SINAPAD, CENAPAD), pero en tu laboratorio casi nadie sabe usarlo.
  • 📉
    Un revisor te pidió “extender las simulaciones” y tuviste que marear la respuesta porque no tenías infraestructura ni apoyo técnico.
  • 😰
    La terminal negra te intimida. Ves a alguien escribir comandos a toda velocidad y sientes que ese mundo no es para ti.

Lo que te llevas en solo 2 fines de semana

No vas a ver pantallas de ejemplo. Vas a entrar a un clúster HPC real, con tu usuario, conectándote desde tu propia computadora y corriendo trabajos de verdad.

  • Conexión SSH a cualquier clúster HPC
  • Manejo fluido de Linux en servidores
  • Transferencia de datos masivos (segura)
  • Automatización con scripts
  • Gestión de software científico (GROMACS 2025)
  • Envío y monitoreo de jobs con SLURM
  • Optimización de ns/día en simulaciones

El objetivo es simple: que después de estas 14 horas puedas entrar al clúster de tu institución con calma, sin depender de “la persona de sistemas”.

Lo que hace diferente a este curso

Aprendes donde se hace ciencia de verdad

Desde el minuto uno estás conectado a un nodo de login de un clúster HPC real en la nube, similar al que mencionan los papers que lees.

No practicamos comandos, operamos un clúster

Cada comando afecta un sistema de archivos distribuido. Cada job pasa por un gestor de colas real (SLURM), como en el Barcelona Supercomputing Center.

Enfocado en científicos, no en devs

El lenguaje, los ejemplos y los casos de uso están pensados para biólogos, químicos, biomédicos y gente de laboratorio que quiere publicar mejor.

Lo que verás en el Curso 1

Bloque I — Arquitectura del poder computacional

Qué pasa dentro de un nodo cuando corre tu sistema, por qué InfiniBand puede ser 10 veces más rápido que el ethernet de tu oficina y cuándo realmente necesitas un supercomputador.

Bloque II — El lenguaje de los servidores

Linux como idioma de todos los supercomputadores del mundo: moverte por el sistema de archivos, buscar, filtrar y manipular datos sin miedo a la terminal.

Bloque III — Automatización del científico inteligente

De hacer todo a mano a orquestar pipelines reproducibles con scripts. La diferencia entre “yo uso herramientas” y “yo diseño flujos de trabajo”.

Bloque IV — El dominio del gestor de colas (SLURM)

Escribes scripts de SLURM profesionales, lanzas un benchmark de CPU con GROMACS y calculas tú mismo qué configuración te da más ns/día.

De cero a publicaciones Q1: la ruta MD Elite en 5 sprints

El Curso 1 es solo el inicio. Si quieres recorrer la ruta completa, estos son los 5 sprints que te llevan desde “nunca toqué un clúster” hasta ejecutar simulaciones de 100 ns con análisis completo y MMPBSA.

Sprint 1 · Curso 1

Linux & HPC para Científicos · $59 USD
  • Te conectas a un clúster real por SSH.
  • Envíes tus primeros jobs con SLURM.
  • Entiendes qué está pasando “detrás del telón”.

Sprint 2 · Curso 2

Preparación de Sistemas Moleculares · $59 USD
  • Partes de una estructura del RCSB PDB.
  • Limpias, generas topologías y parametrizas ligandos.
  • Solvatas y neutralizas el sistema listo para MD.

Sprint 3 · Curso 3

Pipeline de Simulación GROMACS · $69 USD
  • Montas el pipeline de simulación de punta a punta.
  • Automatizas fases y archivos de entrada/salida.
  • Dejas al clúster trabajando mientras tú analizas.

Sprint 4 · Curso 4

Análisis de Trayectorias Completo · $79 USD
  • Extraes RMSD, RMSF, radio de giro, SASA, puentes H, etc.
  • Transformas gigabytes de trayectoria en figuras y tablas.
  • Generas material directo para la sección de Resultados.

Sprint 5 · Curso 5

MMPBSA — Energía Libre de Unión · $89 USD
  • Calculas energías libres de unión con MMPBSA.
  • Cuantificas estabilidad y afinidad de complejos.
  • Cierras el ciclo con métricas publicables en revistas Q1.
Ruta Completa — 5 Sprints · $297 USD (aprox. $5,168 MXN)

Incluye los 5 cursos, acceso a la comunidad permanente y un ahorro de $58 USD frente a comprar cada curso por separado.

Quiero la ruta completa

¿Quiénes te acompañan en el proceso?

Fabián Jiménez Investigador doctoral · CTO en NF Innovations

Especialista en medicina computacional y simulación molecular. Conecta infraestructura GPU de frontera con diseño racional de fármacos para enfermedades catastróficas.

William Lituma Biomédico · Bioinformática y quimioinformática

Trabaja en análisis genómico, modelado molecular, docking y dinámica molecular, conectando datos biológicos con decisiones de investigación de alto impacto.

Hugo Chancay Físico · Sistemas dinámicos y computación cuántica

Domina simulaciones de DFT y sistemas cuánticos, utilizando Python para análisis numérico y visualización de fenómenos complejos.

Son tres perfiles distintos con una sola intención: que tu HPC deje de ser teoría bonita en papers y se convierta en resultados de tu propio grupo.

Preguntas frecuentes

¿Necesito ser programador?

No. Necesitas ser científico con curiosidad y ganas de ensuciarte las manos con la terminal. Nosotros te guiamos paso a paso.

¿Y si nunca he usado Linux?

Perfecto. El curso está pensado precisamente para que Linux deje de ser un muro y se vuelva una herramienta más de tu día a día.

¿Voy a poder aplicar esto en el clúster de mi institución?

Sí. Los conceptos de conexión, manejo de archivos, módulos y SLURM son los mismos en la mayoría de centros de supercómputo.

¿Qué obtengo al finalizar?

Un certificado con validez de la red SEP-CONOCER, autonomía tecnológica para correr tus propios experimentos y una ventaja real frente a otros perfiles que siguen dependiendo de “alguien de sistemas”.

¿Listo para dejar de solo leer simulaciones y empezar a escribir las tuyas?

Si llevas tiempo sintiendo que podrías hacer más con tus datos, pero la parte computacional te frena, este es tu punto de inflexión. No necesitas esperar a “tener tiempo” o a que alguien configure todo por ti. Puedes empezar este mismo cohorte.

Respondemos en menos de 24 horas, con respuestas técnicas reales, no con guiones de ventas.